В администрацию президента переходили 12 бывших глав регионов. Сергей Собянин (Тюменская область) в 2005–2008 годах возглавлял администрацию. Мурат Зязиков (Ингушетия) в 2008–2012 годах был советником президента. Помощниками главы администрации в 2007 году становились Олег Кожемяко (Корякский автономный округ), Геннадий Ходырев (Нижегородская область), Леонид Потапов (Бурятия), Михаил Машковцев (Камчатский край), в 2008 году — Баир Жамсуев (Агинский Бурятский АО) и Георгий Шпак (Рязанская область). Полпредами президента в федеральных округах назначались Виктор Ишаев (Хабаровский край, 2009–2012), Виктор Толоконский (Новосибирская область, 2010–2014).Также в 2010 году Александр Хлопонин (Красноярский край) стал одновременно полпредом (занимал эту должность до 2014 года) и вице-премьером. С 2013 года Магомедсалам Магомедов (Дагестан) является заместителем главы администрации президента.
Заместителями главы правительства становились четверо экс-губернаторов. Владимир Полеванов (Амурская область) в 1994–1995 годах одновременно возглавлял Госкомимущество. Первыми вице-премьерами были Борис Немцов (Нижегородская область, 1997–1998) и Вадим Густов (Ленинградская область, 1998–1999). Владимира Яковлева (Санкт-Петербург) в 2003 году назначили «обычным» вице-премьером, а с 2004 по 2007 год он возглавлял Минрегион.
Федеральными министрами становились девять человек. Юрий Шафраник (Тюменская область) в 1993–1996 годах возглавлял Минтопэнерго, Николай Егоров (Краснодарский край) с 1994 по 1995 год был министром по делам национальностей, а с января по июль 1996 года возглавлял администрацию президента РФ, Владимир Елагин (Оренбургская область) в 2000–2002 годах был министром по социально-экономическому развитию Чеченской Республики, Юрий Трутнев (Пермская область) в 2004–2012 годах был министром природных ресурсов. Министерством регионального развития с 2012 года и до его ликвидации в 2014 году руководил Игорь Слюняев (Костромская область), Минобороны с 2012 года ‒ Сергей Шойгу (Московская область). В 2013 году министром строительства и жилищно-коммунального хозяйства стал Михаил Мень (Ивановская область). В 2014 году министром по делам Северного Кавказа стал Лев Кузнецов (Красноярский край). Минсельхоз с 2012 года до отставки в апреле 2015 года возглавлял Николай Федоров (Чувашия).
Заместителем министра сельского хозяйства в 1996–1997 годах работал Александр Беляков (Ленинградская область). Заместителями главы Минрегиона работали Сергей Дарькин (Приморский край), Сергей Вахруков (Ярославская область, в2013 году стал помощником секретаря Совета безопасности) и Валерий Гаевский (Ставропольский край, с марта 2015 года ‒ замминистра сельского хозяйства).
Двое экс-губернаторов получали федеральные ведомства. Михаил Кислюк (Кемеровская область) в 1997–1998 годах был руководителемФедеральной службы по регулированию естественных монополий на транспорте, а Евгений Наздратенко (Приморский край) в 2001‒2003 годах возглавлял Госкомрыболовство.